En el cerebro, de arriba a abajo y de abajo a arriba no son, en realidad, procesos separados. Los teóricos los separan artificialmente para hablar de ellos.
En términos de cognición, un proceso de abajo hacia arriba ocurre cuando algo inesperado se mueve en la esquina de su ojo y llama su atención. Esto hace que mires y reacciones. La señal que causa esta cadena de eventos se originó en el ambiente, en la “parte inferior” de la corriente de procesamiento sensorial. 
Un proceso de arriba hacia abajo es como tratar de encontrar a Waldo en “¿Dónde está Waldo?”. Comienza con un objetivo interno de “alto nivel”, que determina dónde se ve a continuación. Usted está buscando “algo”, por lo que las áreas del cerebro de nivel superior “ceban” las áreas visuales de bajo nivel para detectar ese patrón. 
En términos de cómo funciona en el cerebro, la forma más fácil de pensar podría ser hacer una analogía con la comunicación dentro de una corporación más grande.
De abajo hacia arriba es el proceso mediante el cual el comité ejecutivo descubre qué está sucediendo en el mercado (el mundo exterior). El personal de ventas y marketing de primera línea notan patrones y tendencias. Hablan sobre estas tendencias entre ellos y con sus gerentes. Los gerentes hablan entre ellos y con los directores, quienes luego conversan con los vicepresidentes, quienes a su vez forman parte del comité ejecutivo. Así que la información brota a través de la organización.
De arriba a abajo es cuando el comité ejecutivo llega a un consenso de que la estrategia comercial o de productos de la empresa debe ir en una nueva dirección. Los vicepresidentes en el comité implementan cambios con los directores, quienes reasignan el trabajo de los gerentes, quienes cambian las prioridades de las personas de primera línea.
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En el cerebro, el equivalente jerárquico para la visión sería (comenzando desde la parte inferior) el área cortical V1 -> V2 -> V4 -> IT / LOC ->… -> corteza prefrontal (PFC) (arriba). La corteza prefrontal es el equivalente en el cerebro del comité ejecutivo corporativo. En lo auditivo, podría ir A1 -> A2 -> área de Wernicke ->… -> corteza prefrontal.
Pero en realidad, tanto para la corporación como para el cerebro, nunca es tan lineal.
La comunicación ocurre en direcciones “arriba” y “abajo” en todos los niveles todo el tiempo. Y hay comunicación que omite niveles (por ejemplo, V1 -> V4), además de mucha “comunicación lateral” dentro de los niveles, y comunicación que va desde y hacia otras áreas del cerebro “no jerárquicas”.
Un patrón universal en la corteza cerebral es que cada vez que un área del cerebro tiene un camino (posiblemente hacia adelante) hacia otro, siempre hay un camino inverso (retroalimentación) de regreso. Estas vías bidireccionales permiten que se produzca un flujo de información bidireccional. A veces, este flujo de información bidireccional tiene una clara asimetría en la parte inferior, y otras veces no.
Entonces, la realidad es más bien como flujos continuos de información bidireccional y multidireccional, donde “abajo” se define como regiones que reciben información sensorial directa, y “arriba” es cualquier área del cerebro que está lejos del fondo. En términos de la cadena causal de eventos, las señales de abajo hacia arriba se originan con un cambio en el entorno, y las señales de arriba hacia abajo se originan con un nuevo objetivo interno.