¿Cómo puedo ingresar a la neurociencia computacional si tengo una licenciatura en neurociencia y soy competente en Python?

Hay muchos caminos para entrar en la neurociencia computacional …

Si alguien en su universidad está haciendo modelado computacional, neurociencia teórica o “neurociencia de sistemas”, podría tener sentido preguntarles si existe un camino en su universidad, por ejemplo, crear un proyecto personalizado en colaboración con alguien en aprendizaje estadístico de máquinas en El departamento de CS. Pero es mucho mejor estar en un laboratorio que está haciendo activamente modelos computacionales, lo que podría requerir un cambio en las universidades.

La mejor manera de hacer una “transición de carrera” en la neurociencia computacional puede ser asistir a uno de los varios programas de la escuela de verano en ella. Hay uno en Cold Spring Harbor Labs, y también en Woods Hole. Ocasionalmente ha habido programas de verano en el Instituto de Santa Fe o en Kioto en Japón. Estos programas de verano de 3 a 6 semanas son cursos intensivos de modelado computacional, impartidos en colaboración por 10 a 20 de los mejores investigadores en el campo. Te expones a todo el campo, escuchas muchos puntos de vista de los pensadores principales y haces muchas conexiones.

Usted podría asistir a una reunión de investigación de neurociencia computacional. Por ejemplo, COSYNE (COmputational and SYstems NEuroscience), febrero en Salt Lake City, Utah, es posiblemente el mejor campo; La Computational Neuroscience Society (CNS) en el verano, que se mueve y alterna entre Estados Unidos y Europa también es buena; Los NIPS (Sistemas de procesamiento de información neural) en diciembre son más de una conferencia estadística de aprendizaje automático y matemáticas en estos días, pero asisten muchos neurocientíficos computacionales. Pasar por la sesión de pósters permitiría obtener información privilegiada sobre todos los laboratorios, quién está haciendo qué y en qué universidades desearía terminar.

Estoy de acuerdo en que el camino más productivo para comprender cómo funciona el cerebro es observar cómo las poblaciones, los circuitos y los sistemas de neuronas intercambian señales en colaboración para producir un comportamiento colectivo. Esta es la frontera actual en la neurociencia de los sistemas, y la única razón por la que no se hace más trabajo es porque es muy difícil obtener datos sobre grandes poblaciones de neuronas en un organismo vivo. Sin embargo, la reciente vía de la optogenética está abriendo nuevas y tremendas fuentes de datos y acceso a cómo las neuronas se comportan como poblaciones in vivo .

Aquí hay una muy buena guía escrita por Adrienne Fairhall:

Persiguiendo la neurociencia computacional

No es necesario unirse a un programa de postgrado en neurociencia computacional. De hecho, no estoy a favor de tales programas y aquí en UW hemos optado por no tomar ese camino: creo que la neurociencia computacional es el programa interdisciplinario por excelencia, y es importante dominar al menos una disciplina. Por lo tanto, tiendo a preferir basarme en un departamento de origen que proporciona el conjunto de habilidades básicas y la base de conocimientos que busca: neurobiología, informática, física, estadística, ingeniería eléctrica, bioingeniería o matemáticas, pero hacerlo en un lugar con oportunidades y pistas comprobadas. registro de colaboraciones interdepartamentales y apertura a proyectos interdisciplinarios de tesis. De esa manera, se asegurará de que sus cursos básicos sean una preparación sólida para una disciplina académica, pero que tenga la oportunidad de tomar una variedad de asignaturas optativas que le permitan obtener una amplia capacitación en otras áreas, y que su investigación interdisciplinaria será Justo y servicialmente guiado y evaluado.

Muy pocas instituciones tienen un programa de “neurociencia computacional”. Debes mirar para ver qué programas de posgrado (por ejemplo, Neurobiología y Comportamiento , Informática e Ingeniería , Matemáticas Aplicadas ) tienen la facultad cuyo trabajo te interesa, y dónde podrás realizar los cursos e investigaciones que tienes en mente: Ser múltiples opciones. También tenga cuidado de adaptar su elección de institución y programa a la dirección que lo motiva, ya sea profundizando en las matemáticas básicas de las redes neuronales caóticas, investigando el comportamiento de toma de decisiones y / o los circuitos en primates o roedores, trabajando estrechamente con Aplicaciones clínicas o dispositivos de desarrollo. Todo esto requiere una formación bastante distinta.

De alguna manera, sin embargo, esto puede ser difícil. Si no tiene matemáticas más allá de Calc II, sería difícil participar en programas distintos a los programas tradicionales de biología / neurociencia (muchos de los cuales requieren que haga rotaciones con varios profesores, aunque la mayoría de los programas tradicionales de biología / neurociencia tienen La investigación sobre “laboratorios húmedos” y la mayor parte de su capacitación en estos programas lo prepararán para más cosas de “laboratorios húmedos” (hay algunas excepciones). Sin embargo, realmente podría beneficiarse de las rotaciones si le permiten rotar con los profesores de otros departamentos que, en su mayoría, hacen investigación computacional.

Alternativamente, podrías probar algunos programas de posgrado en psicología / psicología cognitiva. Mucha de la investigación en esos programas es computacional, y es menos probable que requieran una base matemática más rigurosa. Como ejemplo, vea el Laboratorio de Neurociencia Cognitiva Computacional en el Departamento de Psicología y Ciencias del Cerebro. Además, la investigación en los departamentos de Psicología suele ser más “global” que la investigación en los departamentos de Biología Molecular o Neurociencia.

Si es posible, tome cursos de matemática e informática en la institución en la que se encuentre, incluso si solo se trata de auditarlos (pero asegúrese de hacer el trabajo). No es imposible realizar una capacitación en el trabajo para ponerse al día con las matemáticas, pero de ninguna manera es fácil u óptimo.

Puedo entender totalmente. Esto es raro Al igual que totalmente. Por otra parte, el curso exige personas de fondo de computadoras. Pensé en inscribirme en este curso y esto es lo que puedo leer:

Antecedentes recomendados
Familiaridad con conceptos básicos en álgebra lineal, cálculo y teoría de probabilidad. Específicamente, la capacidad de comprender ecuaciones simples que involucran vectores y matrices, diferenciar funciones simples y entender qué es una distribución de probabilidad. Para los ejercicios, algo de familiaridad con Matlab u Octave sería útil. No se requieren antecedentes previos en neurociencia.

Puedo entender totalmente lo mal que quieres hacerlo. Porque esa había sido mi preocupación también. Había una manera en que pensé que esto podría ser posible. Ya que ha mencionado que está en la escuela de posgrado y necesita un panorama general de los sistemas, ¿por qué no solicitar una especialización de doctorado en neurociencia computacional?

Digamos que tienes dos años mientras estás en un programa de doctorado. Si bien una persona con experiencia en computación estaría estudiando lo que ya ha estudiado en neurociencia, puede concentrarse en obtener eficiencia en matemáticas y código.

Piénsalo.

Encuentre un grupo de investigación que esté trabajando en el problema que le interesa y comience a colaborar con ellos.

Leyendo su historia: tenga en cuenta que el campo puede no ser lo que espera que sea. Usted dice que quiere estudiar redes, pero puede ser que mucha investigación en redes sea molecular, no (todavía) tan computacional.